Пустозерск зажёгся яркой заполярной звёздочкой сразу после основания, когда в 1499 году военная экспедиция Ивана III достигла дельты Печоры, около озера Пустое. Небольшой острог за три века превратился в центр Печорского края, северный торговый путь и прославился Крещенскими ярмарками, на которые собиралось всё Поморье. Активная торговля привлекла внимание заморских купцов, которые начали спекулировать пушниной, поэтому царь Михаил Романов запретил жителям Севера торговать с иностранцами. Затем появились более удобные пути через Урал, город многократно разоряли ненецкие племена, а острог был разобран по приказу Екатерины II. Город также стремительно угасал, хотя последняя жительница уехала из Пустозерска только в 1962 году. Но в истории он навсегда остался первым русским городом за полярным кругом.
Спустя два года после того, как Пустозерск опустел, на месте соборного храма во имя Преображения Господня был установлен памятный знак, сложенный из камней его фундамента. В 1991 году в Нарьян-Маре в память о легендарном городе был основан историко-культурный и ландшафтный музей-заповедник «Пустозерск». Музей расположился в историческом доме Шевелёвых. Это единственное здание, оставшееся от Пустозерска, поскольку ещё в 30-е годы ХХ века его разобрали и перевезли в Нарьян-Мар для консервации. Официально музей был открыт в 2004 году, а в 2012 году на месте пустозерского городища в рамках региональной программы начали возводить реконструированный острог с башнями и подворьем. Из-за нехватки средств строительство было остановлено спустя пять лет. В юбилейный год администрация НАО приняла решение возобновить строительные работы, чтобы к 2020 году в регионе появился экспозиционный комплекс под открытым небом «Дом и усадьба жителя Пустозерской волости конца XIX — начала XX веков». Он будет состоять из типичного мещанского дома с амбарами и баней, причём для проекта реконструируют даже самые небольшие предметы быта и церковную утварь.
